امروزه گیاهان دارویی با روشهای مختلف ضدعفونی میشوند که هر کدام از این روش‌ها تاثیرات متفاوتی بر بار میکروبی آنها میگذارد. بنابراین استفاده از روش‌هایی که تاثیر زیادی در سالم سازی و کمترین تاثیر را روی مواد موثره این گیاهان داشته باشد ضروری است.