باغ گیاهشناسی کاشان به مساحت ۲۵ هکتار بر اساس طرح مصوب تحقیقاتی از سال ۱۳۷۲ در محل ایستگاه تحقیقات مناطق خشک و بیابانی کاشان احداث گردید. محل این باغ در جناح شمال شرقی و جنب میدان بسیج شهرستان کاشان (ابتدای بلوار دارالسلام) قرار گرفته است. کلکسیونهای مختلف باغ گیاه شناسی کاشان عبارتند از: کلکسیون گیاهان شن‎دوست، کلکسیون گیاهان داروئی، قطعه باغ گیاهان صخره‎ای، باغ درختان مثمر، قطعه گیاهان شورپسند، قطعه گیاهان آموزشی، قطعه گیاهان آبزی، قطعه گیاهان گچ دوست، قطعه گیاهان بیگانه، قطعه گیاهان کامفیت (بالشتکی) و قطعه درختچه‎های مسیر آبراهه‎های کوهستانی.