پژوهشکده زعفران تربت حیدریه در جنوب غربی پارک جنگلی پیشکوه در تاریخ ۳ خرداد ۱۳۸۶ با اقدام به ساخت بنای مجتمع از محل اعتبارات ریاست جمهوری آماده راه اندازی و نهایتا در ۱۳۹۱/۹/۱ با اتمام ساختمان پژوهشکده آماده بهره گردید. این پژوهشکده در اسفند سال ۱۳۹۱ از دانشگاه فردوسی منفک شده و بطور رسمی تحویل دانشگاه تربت حیدریه گردید.
اهداف و برنامه ها:
۱- فعالیت های پژوهشی و آموزشی در چار چوب علوم رایج و فنآوری های پیشرفته با تکیه بر کاربردی بودن
۲- ارتباط علمی کسترده در خصوص زعفران به منظور تقویت جایگاه تولید کشور ایران در بازار تولید جهانی
۳- حفظ ذخایر ژنی و متنوع زیستی زعفران و حمایت از حقوق آثار فکری و دانش بومی زعفران